Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFSF9P41273 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFSF9P41273 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms