Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX2P40425 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX2P40425 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX2P40425 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX2P40425 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX2P40425 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX2P40425 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX2P40425 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX2P40425 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX2P40425 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX2P40425 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX2P40425 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX2P40425 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX2P40425 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX2P40425 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX2P40425 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX2P40425 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX2P40425 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX2P40425 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX2P40425 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX2P40425 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX2P40425 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX2P40425 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX2P40425 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX2P40425 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX2P40425 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX2P40425 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX2P40425 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX2P40425 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms