Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFBP38117 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFBP38117 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFBP38117 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFBP38117 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFBP38117 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFBP38117 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETFBP38117 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETFBP38117 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETFBP38117 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFBP38117 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFBP38117 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFBP38117 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFBP38117 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFBP38117 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFBP38117 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETFBP38117 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETFBP38117 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ETFBP38117 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ETFBP38117 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETFBP38117 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETFBP38117 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFBP38117 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFBP38117 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFBP38117 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFBP38117 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFBP38117 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFBP38117 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFBP38117 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETFBP38117 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETFBP38117 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETFBP38117 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETFBP38117 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFBP38117 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFBP38117 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFBP38117 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFBP38117 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFBP38117 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETFBP38117 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFBP38117 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFBP38117 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFBP38117 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFBP38117 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFBP38117 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFBP38117 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFBP38117 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETFBP38117 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms