Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FDFT1P37268 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FDFT1P37268 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms