Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHI3L1P36222 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHI3L1P36222 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms