Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH11P35749 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH11P35749 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH11P35749 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH11P35749 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH11P35749 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH11P35749 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH11P35749 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH11P35749 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH11P35749 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH11P35749 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH11P35749 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH11P35749 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH11P35749 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH11P35749 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH11P35749 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH11P35749 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH11P35749 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH11P35749 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH11P35749 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH11P35749 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH11P35749 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH11P35749 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH11P35749 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH11P35749 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH11P35749 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH11P35749 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH11P35749 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH11P35749 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH11P35749 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH11P35749 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH11P35749 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH11P35749 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH11P35749 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH11P35749 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH11P35749 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH11P35749 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH11P35749 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH11P35749 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYH11P35749 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms