Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC1P35251 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC1P35251 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC1P35251 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC1P35251 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC1P35251 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC1P35251 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC1P35251 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC1P35251 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC1P35251 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC1P35251 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC1P35251 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC1P35251 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC1P35251 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC1P35251 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC1P35251 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC1P35251 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC1P35251 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC1P35251 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC1P35251 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC1P35251 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC1P35251 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC1P35251 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFC1P35251 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFC1P35251 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms