Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RDXP35241 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDXP35241 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDXP35241 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDXP35241 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDXP35241 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDXP35241 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDXP35241 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDXP35241 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDXP35241 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDXP35241 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDXP35241 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDXP35241 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDXP35241 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDXP35241 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RDXP35241 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RDXP35241 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDXP35241 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDXP35241 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDXP35241 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDXP35241 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDXP35241 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDXP35241 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDXP35241 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDXP35241 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDXP35241 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDXP35241 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDXP35241 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDXP35241 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDXP35241 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDXP35241 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RDXP35241 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDXP35241 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDXP35241 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDXP35241 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RDXP35241 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDXP35241 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RDXP35241 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDXP35241 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDXP35241 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDXP35241 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDXP35241 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDXP35241 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDXP35241 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDXP35241 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDXP35241 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDXP35241 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms