Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA1P35221 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNNA1P35221 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms