Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H1P32780 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms