Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3AP31941 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC3AP31941 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms