Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXA7P31268 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA7P31268 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms