Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA10P31260 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms