Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms