Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH4A1P30038 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALDH4A1P30038 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALDH4A1P30038 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms