Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP1P29466 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP1P29466 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP1P29466 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP1P29466 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP1P29466 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP1P29466 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP1P29466 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP1P29466 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP1P29466 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP1P29466 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP1P29466 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP1P29466 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP1P29466 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP1P29466 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP1P29466 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP1P29466 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP1P29466 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP1P29466 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP1P29466 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP1P29466 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP1P29466 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP1P29466 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP1P29466 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP1P29466 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP1P29466 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP1P29466 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP1P29466 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP1P29466 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP1P29466 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP1P29466 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP1P29466 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP1P29466 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP1P29466 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP1P29466 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP1P29466 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CASP1P29466 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP1P29466 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP1P29466 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP1P29466 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP1P29466 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP1P29466 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP1P29466 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP1P29466 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP1P29466 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP1P29466 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP1P29466 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP1P29466 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP1P29466 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP1P29466 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP1P29466 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP1P29466 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP1P29466 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP1P29466 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP1P29466 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms