Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRABP2P29373 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRABP2P29373 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRABP2P29373 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms