Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARK3P27448 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARK3P27448 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARK3P27448 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARK3P27448 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARK3P27448 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARK3P27448 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARK3P27448 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARK3P27448 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARK3P27448 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARK3P27448 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARK3P27448 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARK3P27448 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARK3P27448 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARK3P27448 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARK3P27448 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MARK3P27448 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARK3P27448 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MARK3P27448 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MARK3P27448 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MARK3P27448 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARK3P27448 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARK3P27448 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARK3P27448 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARK3P27448 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARK3P27448 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARK3P27448 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARK3P27448 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARK3P27448 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARK3P27448 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARK3P27448 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARK3P27448 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARK3P27448 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARK3P27448 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARK3P27448 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARK3P27448 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARK3P27448 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARK3P27448 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARK3P27448 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARK3P27448 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MARK3P27448 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARK3P27448 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARK3P27448 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARK3P27448 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARK3P27448 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARK3P27448 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARK3P27448 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARK3P27448 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARK3P27448 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARK3P27448 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARK3P27448 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARK3P27448 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARK3P27448 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MARK3P27448 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARK3P27448 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARK3P27448 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARK3P27448 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARK3P27448 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARK3P27448 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms