Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL13P26373 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL13P26373 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL13P26373 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL13P26373 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL13P26373 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL13P26373 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL13P26373 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL13P26373 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL13P26373 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL13P26373 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL13P26373 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL13P26373 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL13P26373 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL13P26373 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL13P26373 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL13P26373 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL13P26373 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL13P26373 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL13P26373 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL13P26373 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL13P26373 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL13P26373 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL13P26373 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL13P26373 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL13P26373 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL13P26373 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL13P26373 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL13P26373 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL13P26373 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL13P26373 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL13P26373 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL13P26373 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL13P26373 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL13P26373 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPL13P26373 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms