Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
DNMT1P26358 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
DNMT1P26358 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
DNMT1P26358 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DNMT1P26358 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms