Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN3P26045 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms