Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRM1P23921 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRM1P23921 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRM1P23921 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRM1P23921 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRM1P23921 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRM1P23921 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRM1P23921 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRM1P23921 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRM1P23921 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRM1P23921 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRM1P23921 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRM1P23921 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRM1P23921 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRM1P23921 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRM1P23921 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRM1P23921 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRM1P23921 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRM1P23921 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRM1P23921 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRM1P23921 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRM1P23921 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRM1P23921 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRM1P23921 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRM1P23921 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRM1P23921 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRM1P23921 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRM1P23921 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRM1P23921 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRM1P23921 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM1P23921 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM1P23921 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM1P23921 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM1P23921 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM1P23921 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM1P23921 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM1P23921 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRM1P23921 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms