Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP100P23497 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP100P23497 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SP100P23497 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP100P23497 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP100P23497 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP100P23497 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP100P23497 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP100P23497 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP100P23497 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP100P23497 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP100P23497 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP100P23497 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP100P23497 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP100P23497 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP100P23497 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP100P23497 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP100P23497 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SP100P23497 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP100P23497 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SP100P23497 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP100P23497 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP100P23497 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP100P23497 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SP100P23497 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP100P23497 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP100P23497 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SP100P23497 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP100P23497 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP100P23497 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP100P23497 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP100P23497 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP100P23497 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP100P23497 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP100P23497 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP100P23497 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP100P23497 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SP100P23497 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP100P23497 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SP100P23497 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SP100P23497 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SP100P23497 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SP100P23497 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP100P23497 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP100P23497 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP100P23497 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP100P23497 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SP100P23497 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP100P23497 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms