Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCP2P22307 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCP2P22307 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCP2P22307 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCP2P22307 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCP2P22307 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCP2P22307 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCP2P22307 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCP2P22307 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCP2P22307 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCP2P22307 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCP2P22307 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCP2P22307 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCP2P22307 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCP2P22307 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCP2P22307 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCP2P22307 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCP2P22307 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCP2P22307 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCP2P22307 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCP2P22307 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCP2P22307 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCP2P22307 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCP2P22307 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCP2P22307 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCP2P22307 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCP2P22307 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCP2P22307 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCP2P22307 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCP2P22307 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCP2P22307 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCP2P22307 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCP2P22307 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCP2P22307 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCP2P22307 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCP2P22307 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCP2P22307 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCP2P22307 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCP2P22307 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCP2P22307 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCP2P22307 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms