Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BGNP21810 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BGNP21810 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BGNP21810 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BGNP21810 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BGNP21810 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BGNP21810 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BGNP21810 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BGNP21810 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BGNP21810 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BGNP21810 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BGNP21810 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BGNP21810 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BGNP21810 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BGNP21810 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BGNP21810 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BGNP21810 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BGNP21810 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BGNP21810 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BGNP21810 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BGNP21810 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BGNP21810 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BGNP21810 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BGNP21810 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BGNP21810 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BGNP21810 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BGNP21810 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BGNP21810 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BGNP21810 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BGNP21810 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BGNP21810 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BGNP21810 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BGNP21810 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BGNP21810 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BGNP21810 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BGNP21810 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BGNP21810 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BGNP21810 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BGNP21810 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BGNP21810 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BGNP21810 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BGNP21810 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms