Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSR1P21757 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSR1P21757 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSR1P21757 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSR1P21757 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSR1P21757 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSR1P21757 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSR1P21757 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSR1P21757 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSR1P21757 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSR1P21757 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSR1P21757 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSR1P21757 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSR1P21757 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MSR1P21757 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSR1P21757 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSR1P21757 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSR1P21757 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSR1P21757 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSR1P21757 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSR1P21757 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MSR1P21757 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSR1P21757 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSR1P21757 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSR1P21757 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSR1P21757 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSR1P21757 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSR1P21757 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSR1P21757 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSR1P21757 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSR1P21757 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSR1P21757 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSR1P21757 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSR1P21757 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSR1P21757 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSR1P21757 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSR1P21757 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSR1P21757 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSR1P21757 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSR1P21757 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms