Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK11BP21127 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK11BP21127 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms