Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CASTP20810 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CASTP20810 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CASTP20810 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASTP20810 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASTP20810 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASTP20810 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASTP20810 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASTP20810 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASTP20810 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CASTP20810 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CASTP20810 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASTP20810 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASTP20810 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASTP20810 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASTP20810 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASTP20810 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASTP20810 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASTP20810 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASTP20810 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASTP20810 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASTP20810 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASTP20810 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASTP20810 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASTP20810 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CASTP20810 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASTP20810 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASTP20810 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASTP20810 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASTP20810 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASTP20810 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASTP20810 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASTP20810 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASTP20810 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASTP20810 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASTP20810 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASTP20810 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASTP20810 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASTP20810 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASTP20810 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASTP20810 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASTP20810 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASTP20810 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASTP20810 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASTP20810 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASTP20810 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASTP20810 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASTP20810 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms