Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGCP20142 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PGCP20142 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGCP20142 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGCP20142 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGCP20142 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGCP20142 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGCP20142 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGCP20142 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGCP20142 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGCP20142 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGCP20142 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGCP20142 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGCP20142 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGCP20142 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGCP20142 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGCP20142 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGCP20142 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGCP20142 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGCP20142 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGCP20142 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGCP20142 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms