Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF2P19878 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF2P19878 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF2P19878 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF2P19878 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF2P19878 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF2P19878 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF2P19878 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF2P19878 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF2P19878 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF2P19878 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF2P19878 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF2P19878 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF2P19878 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF2P19878 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF2P19878 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF2P19878 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF2P19878 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCF2P19878 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF2P19878 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF2P19878 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF2P19878 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF2P19878 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF2P19878 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF2P19878 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF2P19878 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms