Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB6P18564 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB6P18564 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms