Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XBP1P17861 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XBP1P17861 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XBP1P17861 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XBP1P17861 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XBP1P17861 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XBP1P17861 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XBP1P17861 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XBP1P17861 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XBP1P17861 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XBP1P17861 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XBP1P17861 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XBP1P17861 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XBP1P17861 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
XBP1P17861 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XBP1P17861 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XBP1P17861 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XBP1P17861 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XBP1P17861 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XBP1P17861 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XBP1P17861 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XBP1P17861 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XBP1P17861 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XBP1P17861 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XBP1P17861 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XBP1P17861 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XBP1P17861 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XBP1P17861 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XBP1P17861 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XBP1P17861 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XBP1P17861 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XBP1P17861 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XBP1P17861 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XBP1P17861 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XBP1P17861 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XBP1P17861 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XBP1P17861 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XBP1P17861 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XBP1P17861 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XBP1P17861 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XBP1P17861 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XBP1P17861 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XBP1P17861 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XBP1P17861 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XBP1P17861 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XBP1P17861 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XBP1P17861 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
XBP1P17861 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XBP1P17861 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XBP1P17861 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XBP1P17861 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XBP1P17861 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XBP1P17861 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XBP1P17861 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
XBP1P17861 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XBP1P17861 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XBP1P17861 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XBP1P17861 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XBP1P17861 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms