Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTPS1P17812 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms