Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF3P17036 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF3P17036 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF3P17036 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms