Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms