Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB3P16520 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB3P16520 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB3P16520 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB3P16520 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB3P16520 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB3P16520 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB3P16520 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GNB3P16520 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GNB3P16520 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GNB3P16520 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GNB3P16520 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms