Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB4P16144 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITGB4P16144 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGB4P16144 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGB4P16144 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms