Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSPP15924 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSPP15924 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSPP15924 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSPP15924 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSPP15924 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSPP15924 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSPP15924 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DSPP15924 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSPP15924 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSPP15924 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSPP15924 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSPP15924 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSPP15924 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSPP15924 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSPP15924 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSPP15924 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSPP15924 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSPP15924 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSPP15924 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSPP15924 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSPP15924 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSPP15924 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSPP15924 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSPP15924 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSPP15924 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSPP15924 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSPP15924 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSPP15924 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSPP15924 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSPP15924 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSPP15924 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSPP15924 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSPP15924 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSPP15924 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSPP15924 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSPP15924 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSPP15924 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSPP15924 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSPP15924 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSPP15924 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSPP15924 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSPP15924 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms