Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF3P15923 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF3P15923 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF3P15923 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF3P15923 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF3P15923 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF3P15923 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF3P15923 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF3P15923 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF3P15923 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF3P15923 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF3P15923 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF3P15923 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF3P15923 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF3P15923 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF3P15923 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF3P15923 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF3P15923 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF3P15923 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF3P15923 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF3P15923 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF3P15923 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF3P15923 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF3P15923 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF3P15923 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF3P15923 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF3P15923 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF3P15923 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF3P15923 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF3P15923 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF3P15923 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF3P15923 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF3P15923 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF3P15923 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF3P15923 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF3P15923 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCF3P15923 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF3P15923 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF3P15923 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF3P15923 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF3P15923 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF3P15923 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF3P15923 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF3P15923 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCF3P15923 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCF3P15923 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCF3P15923 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF3P15923 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCF3P15923 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF3P15923 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF3P15923 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCF3P15923 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms