Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MYOD1P15172 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYOD1P15172 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms