Protein–RNA interactions for Protein: P15086

CPB1, Carboxypeptidase B, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPB1P15086 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPB1P15086 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPB1P15086 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPB1P15086 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPB1P15086 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPB1P15086 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPB1P15086 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPB1P15086 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPB1P15086 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPB1P15086 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPB1P15086 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPB1P15086 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPB1P15086 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPB1P15086 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPB1P15086 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPB1P15086 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPB1P15086 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPB1P15086 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms