Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFAPP14136 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFAPP14136 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFAPP14136 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFAPP14136 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFAPP14136 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFAPP14136 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFAPP14136 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFAPP14136 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GFAPP14136 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFAPP14136 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFAPP14136 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFAPP14136 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFAPP14136 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFAPP14136 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFAPP14136 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFAPP14136 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFAPP14136 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFAPP14136 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFAPP14136 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFAPP14136 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFAPP14136 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFAPP14136 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFAPP14136 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFAPP14136 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms