Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A1P13866 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC5A1P13866 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A1P13866 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms