Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNT1P13805 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms