Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT3P12035 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT3P12035 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT3P12035 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT3P12035 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT3P12035 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT3P12035 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT3P12035 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT3P12035 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT3P12035 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT3P12035 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT3P12035 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT3P12035 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT3P12035 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT3P12035 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT3P12035 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT3P12035 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT3P12035 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT3P12035 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT3P12035 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT3P12035 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT3P12035 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT3P12035 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT3P12035 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT3P12035 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT3P12035 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT3P12035 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT3P12035 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT3P12035 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT3P12035 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT3P12035 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT3P12035 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT3P12035 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT3P12035 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT3P12035 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT3P12035 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT3P12035 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms