Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYNX1P0DP58 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYNX1P0DP58 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms