Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMD1P0DJR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIMD1P0DJR0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms