Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM13P0DJ93 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms