Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM253P0C7T8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM253P0C7T8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms