Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C4AP0C0L4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C4AP0C0L4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms